Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TREX1Q9NSU2 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TREX1Q9NSU2 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TREX1Q9NSU2 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TREX1Q9NSU2 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TREX1Q9NSU2 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TREX1Q9NSU2 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TREX1Q9NSU2 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TREX1Q9NSU2 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms