Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms