Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms