Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms