Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY8

HOPX, Homeodomain-only protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPXQ9BPY8 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOPXQ9BPY8 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOPXQ9BPY8 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOPXQ9BPY8 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOPXQ9BPY8 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.2 ms