Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

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Length 1,192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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PKP4Q99569 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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PKP4Q99569 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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PKP4Q99569 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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PKP4Q99569 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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PKP4Q99569 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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