Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms