Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM41Q8WV44 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM41Q8WV44 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM41Q8WV44 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM41Q8WV44 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM41Q8WV44 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM41Q8WV44 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM41Q8WV44 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM41Q8WV44 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM41Q8WV44 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM41Q8WV44 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM41Q8WV44 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM41Q8WV44 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM41Q8WV44 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM41Q8WV44 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM41Q8WV44 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM41Q8WV44 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM41Q8WV44 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM41Q8WV44 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM41Q8WV44 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM41Q8WV44 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM41Q8WV44 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM41Q8WV44 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM41Q8WV44 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM41Q8WV44 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM41Q8WV44 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM41Q8WV44 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM41Q8WV44 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM41Q8WV44 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM41Q8WV44 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM41Q8WV44 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM41Q8WV44 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM41Q8WV44 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM41Q8WV44 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM41Q8WV44 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM41Q8WV44 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM41Q8WV44 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM41Q8WV44 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM41Q8WV44 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM41Q8WV44 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM41Q8WV44 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM41Q8WV44 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM41Q8WV44 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM41Q8WV44 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM41Q8WV44 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM41Q8WV44 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM41Q8WV44 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM41Q8WV44 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM41Q8WV44 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM41Q8WV44 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM41Q8WV44 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM41Q8WV44 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM41Q8WV44 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM41Q8WV44 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM41Q8WV44 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM41Q8WV44 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM41Q8WV44 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM41Q8WV44 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM41Q8WV44 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM41Q8WV44 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM41Q8WV44 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM41Q8WV44 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM41Q8WV44 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM41Q8WV44 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM41Q8WV44 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM41Q8WV44 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM41Q8WV44 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM41Q8WV44 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM41Q8WV44 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM41Q8WV44 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM41Q8WV44 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM41Q8WV44 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM41Q8WV44 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM41Q8WV44 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM41Q8WV44 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM41Q8WV44 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM41Q8WV44 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM41Q8WV44 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRIM41Q8WV44 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRIM41Q8WV44 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRIM41Q8WV44 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRIM41Q8WV44 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRIM41Q8WV44 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM41Q8WV44 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM41Q8WV44 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM41Q8WV44 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM41Q8WV44 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM41Q8WV44 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM41Q8WV44 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM41Q8WV44 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM41Q8WV44 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM41Q8WV44 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM41Q8WV44 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM41Q8WV44 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM41Q8WV44 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM41Q8WV44 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM41Q8WV44 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM41Q8WV44 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM41Q8WV44 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM41Q8WV44 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms