Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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CLIP4Q8N3C7 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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CLIP4Q8N3C7 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CLIP4Q8N3C7 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CLIP4Q8N3C7 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CLIP4Q8N3C7 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CLIP4Q8N3C7 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CLIP4Q8N3C7 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CLIP4Q8N3C7 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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