Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC12.31□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 AC097478.1-206ENST00000513572 2010 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms