Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY2

TUBA3E, Tubulin alpha-3E chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3EQ6PEY2 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.05■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TUBA3EQ6PEY2 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA3EQ6PEY2 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA3EQ6PEY2 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA3EQ6PEY2 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA3EQ6PEY2 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA3EQ6PEY2 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA3EQ6PEY2 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms