Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRT80Q6KB66 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms