Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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PRAMEF20Q5VT98 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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PRAMEF20Q5VT98 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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PRAMEF20Q5VT98 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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PRAMEF20Q5VT98 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PRAMEF20Q5VT98 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PRAMEF20Q5VT98 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PRAMEF20Q5VT98 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PRAMEF20Q5VT98 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PRAMEF20Q5VT98 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PRAMEF20Q5VT98 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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