Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC11.14□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 NFAT5-209ENST00000567239 6376 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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COL5A1-AS1Q5SY13 MAGEL2-201ENST00000532292 4298 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 BNIP3L-201ENST00000380629 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 ATXN2L-225ENST00000570200 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 ITGAX-201ENST00000268296 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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COL5A1-AS1Q5SY13 CRY2-212ENST00000616623 4204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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COL5A1-AS1Q5SY13 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 MAMDC4-201ENST00000317446 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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COL5A1-AS1Q5SY13 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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COL5A1-AS1Q5SY13 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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COL5A1-AS1Q5SY13 ILDR1-201ENST00000273691 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 SPATA13-203ENST00000382108 8463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 DMBT1-201ENST00000330163 5802 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 DMBT1-206ENST00000368956 5802 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 MYT1-201ENST00000328439 5535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 P2RY8-201ENST00000381297 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 NR4A1-201ENST00000243050 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 PACSIN1-207ENST00000620693 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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