Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms