Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
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