Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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