Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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RTL8BQ17RB0 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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RTL8BQ17RB0 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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RTL8BQ17RB0 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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