Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
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SSX1Q16384 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SSX1Q16384 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SSX1Q16384 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SSX1Q16384 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SSX1Q16384 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SSX1Q16384 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SSX1Q16384 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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SSX1Q16384 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SSX1Q16384 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SSX1Q16384 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SSX1Q16384 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SSX1Q16384 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
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SSX1Q16384 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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SSX1Q16384 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SSX1Q16384 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SSX1Q16384 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
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SSX1Q16384 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SSX1Q16384 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SSX1Q16384 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SSX1Q16384 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SSX1Q16384 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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SSX1Q16384 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SSX1Q16384 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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SSX1Q16384 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
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SSX1Q16384 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SSX1Q16384 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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SSX1Q16384 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
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SSX1Q16384 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SSX1Q16384 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SSX1Q16384 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
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SSX1Q16384 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
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SSX1Q16384 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
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