Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
USF2Q15853 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
USF2Q15853 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
USF2Q15853 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
USF2Q15853 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
USF2Q15853 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
USF2Q15853 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
USF2Q15853 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
USF2Q15853 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
USF2Q15853 TTC39A-202ENST00000262676 6287 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
USF2Q15853 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
USF2Q15853 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
USF2Q15853 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
USF2Q15853 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
USF2Q15853 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
USF2Q15853 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
USF2Q15853 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
USF2Q15853 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
USF2Q15853 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
USF2Q15853 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
USF2Q15853 TRABD2B-202ENST00000606738 7034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
USF2Q15853 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
USF2Q15853 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
USF2Q15853 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
USF2Q15853 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
USF2Q15853 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
USF2Q15853 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
USF2Q15853 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
USF2Q15853 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
USF2Q15853 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
USF2Q15853 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
USF2Q15853 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
USF2Q15853 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
USF2Q15853 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
USF2Q15853 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
USF2Q15853 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
USF2Q15853 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
USF2Q15853 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
USF2Q15853 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
USF2Q15853 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
USF2Q15853 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
USF2Q15853 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
USF2Q15853 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
USF2Q15853 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
USF2Q15853 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
USF2Q15853 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
USF2Q15853 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
USF2Q15853 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
USF2Q15853 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
USF2Q15853 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
USF2Q15853 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
USF2Q15853 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
USF2Q15853 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
USF2Q15853 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
USF2Q15853 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
USF2Q15853 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
USF2Q15853 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
USF2Q15853 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
USF2Q15853 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
USF2Q15853 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
USF2Q15853 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
USF2Q15853 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
USF2Q15853 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
USF2Q15853 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
USF2Q15853 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
USF2Q15853 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
USF2Q15853 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
USF2Q15853 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
USF2Q15853 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
USF2Q15853 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
USF2Q15853 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
USF2Q15853 MAGI1-217ENST00000611645 6398 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
USF2Q15853 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
USF2Q15853 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
USF2Q15853 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
USF2Q15853 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
USF2Q15853 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
USF2Q15853 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
USF2Q15853 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
USF2Q15853 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
USF2Q15853 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
USF2Q15853 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
USF2Q15853 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
USF2Q15853 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
USF2Q15853 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
USF2Q15853 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
USF2Q15853 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
USF2Q15853 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
USF2Q15853 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
USF2Q15853 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
USF2Q15853 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
USF2Q15853 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
USF2Q15853 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
USF2Q15853 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
USF2Q15853 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
USF2Q15853 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
USF2Q15853 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
USF2Q15853 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
USF2Q15853 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
USF2Q15853 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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