Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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