Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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TAF1AQ15573 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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TAF1AQ15573 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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TAF1AQ15573 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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TAF1AQ15573 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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TAF1AQ15573 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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TAF1AQ15573 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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