Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms