Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.4 ms