Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
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