Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BFSP2Q13515 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms