Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
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