Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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SCGB2A2Q13296 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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SCGB2A2Q13296 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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SCGB2A2Q13296 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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SCGB2A2Q13296 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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