Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CAV1Q03135 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CAV1Q03135 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAV1Q03135 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAV1Q03135 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAV1Q03135 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAV1Q03135 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAV1Q03135 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAV1Q03135 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CAV1Q03135 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAV1Q03135 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAV1Q03135 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAV1Q03135 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAV1Q03135 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAV1Q03135 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAV1Q03135 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAV1Q03135 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAV1Q03135 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAV1Q03135 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAV1Q03135 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CAV1Q03135 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAV1Q03135 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAV1Q03135 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAV1Q03135 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CAV1Q03135 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CAV1Q03135 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAV1Q03135 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CAV1Q03135 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CAV1Q03135 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAV1Q03135 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAV1Q03135 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAV1Q03135 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAV1Q03135 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAV1Q03135 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAV1Q03135 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAV1Q03135 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAV1Q03135 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAV1Q03135 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAV1Q03135 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAV1Q03135 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAV1Q03135 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAV1Q03135 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAV1Q03135 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAV1Q03135 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAV1Q03135 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAV1Q03135 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms