Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms