Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms