Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms