Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms