Protein–RNA interactions for Protein: P55157

MTTP, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTTPP55157 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTTPP55157 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTTPP55157 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTTPP55157 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTTPP55157 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTTPP55157 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTTPP55157 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTTPP55157 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTTPP55157 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTTPP55157 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTTPP55157 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MTTPP55157 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTTPP55157 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTTPP55157 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTTPP55157 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTTPP55157 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTTPP55157 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTTPP55157 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTTPP55157 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTTPP55157 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTTPP55157 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTTPP55157 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTTPP55157 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTTPP55157 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MTTPP55157 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MTTPP55157 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MTTPP55157 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTTPP55157 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MTTPP55157 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTTPP55157 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTTPP55157 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTTPP55157 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTTPP55157 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTTPP55157 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTTPP55157 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTTPP55157 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTTPP55157 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTTPP55157 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTTPP55157 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTTPP55157 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTTPP55157 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTTPP55157 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTTPP55157 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MTTPP55157 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTTPP55157 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTTPP55157 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTTPP55157 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTTPP55157 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTTPP55157 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTTPP55157 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTTPP55157 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTTPP55157 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTTPP55157 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MTTPP55157 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTTPP55157 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTTPP55157 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTTPP55157 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTTPP55157 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTTPP55157 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MTTPP55157 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MTTPP55157 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTTPP55157 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTTPP55157 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTTPP55157 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTTPP55157 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTTPP55157 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MTTPP55157 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTTPP55157 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTTPP55157 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTTPP55157 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTTPP55157 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTTPP55157 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTTPP55157 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTTPP55157 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTTPP55157 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTTPP55157 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTTPP55157 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTTPP55157 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTTPP55157 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTTPP55157 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTTPP55157 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTTPP55157 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTTPP55157 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTTPP55157 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTTPP55157 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTTPP55157 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTTPP55157 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
MTTPP55157 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MTTPP55157 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MTTPP55157 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MTTPP55157 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MTTPP55157 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MTTPP55157 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MTTPP55157 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MTTPP55157 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTTPP55157 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTTPP55157 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTTPP55157 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTTPP55157 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTTPP55157 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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