Protein–RNA interactions for Protein: P43652

AFM, Afamin, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFMP43652 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AFMP43652 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AFMP43652 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AFMP43652 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AFMP43652 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AFMP43652 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AFMP43652 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AFMP43652 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AFMP43652 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AFMP43652 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AFMP43652 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AFMP43652 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AFMP43652 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AFMP43652 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AFMP43652 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AFMP43652 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AFMP43652 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
AFMP43652 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AFMP43652 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AFMP43652 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AFMP43652 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
AFMP43652 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AFMP43652 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AFMP43652 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AFMP43652 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
AFMP43652 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AFMP43652 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AFMP43652 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AFMP43652 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AFMP43652 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AFMP43652 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AFMP43652 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AFMP43652 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AFMP43652 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AFMP43652 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AFMP43652 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AFMP43652 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AFMP43652 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AFMP43652 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AFMP43652 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AFMP43652 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AFMP43652 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AFMP43652 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AFMP43652 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AFMP43652 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AFMP43652 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AFMP43652 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AFMP43652 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AFMP43652 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
AFMP43652 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AFMP43652 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AFMP43652 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AFMP43652 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AFMP43652 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AFMP43652 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AFMP43652 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AFMP43652 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AFMP43652 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AFMP43652 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AFMP43652 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AFMP43652 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AFMP43652 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
AFMP43652 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AFMP43652 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AFMP43652 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AFMP43652 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
AFMP43652 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AFMP43652 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
AFMP43652 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AFMP43652 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AFMP43652 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AFMP43652 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
AFMP43652 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AFMP43652 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AFMP43652 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
AFMP43652 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AFMP43652 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AFMP43652 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AFMP43652 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AFMP43652 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AFMP43652 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AFMP43652 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AFMP43652 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AFMP43652 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AFMP43652 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AFMP43652 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AFMP43652 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AFMP43652 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AFMP43652 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AFMP43652 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AFMP43652 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AFMP43652 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AFMP43652 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AFMP43652 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AFMP43652 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AFMP43652 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AFMP43652 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
AFMP43652 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
AFMP43652 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
AFMP43652 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms