Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms