Protein–RNA interactions for Protein: P29320

EPHA3, Ephrin type-A receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA3P29320 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms