Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms