Protein–RNA interactions for Protein: P24390

KDELR1, ER lumen protein-retaining receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR1P24390 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KDELR1P24390 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms