Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPREP23469 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPREP23469 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPREP23469 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPREP23469 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPREP23469 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPREP23469 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPREP23469 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPREP23469 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPREP23469 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPREP23469 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPREP23469 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPREP23469 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPREP23469 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPREP23469 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPREP23469 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPREP23469 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPREP23469 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPREP23469 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPREP23469 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPREP23469 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPREP23469 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPREP23469 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPREP23469 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPREP23469 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPREP23469 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPREP23469 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPREP23469 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPREP23469 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPREP23469 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPREP23469 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPREP23469 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPREP23469 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPREP23469 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPREP23469 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPREP23469 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPREP23469 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPREP23469 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPREP23469 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPREP23469 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPREP23469 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPREP23469 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPREP23469 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPREP23469 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPREP23469 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPREP23469 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPREP23469 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPREP23469 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPREP23469 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPREP23469 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPREP23469 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPREP23469 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPREP23469 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPREP23469 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPREP23469 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPREP23469 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPREP23469 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPREP23469 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPREP23469 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPREP23469 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPREP23469 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPREP23469 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPREP23469 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPREP23469 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPREP23469 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPREP23469 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPREP23469 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPREP23469 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPREP23469 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPREP23469 AKR1B10P2-201ENST00000577332 927 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPREP23469 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPREP23469 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPREP23469 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPREP23469 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPREP23469 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPREP23469 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPREP23469 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPREP23469 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPREP23469 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPREP23469 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPREP23469 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPREP23469 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPREP23469 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPREP23469 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPREP23469 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPREP23469 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPREP23469 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPREP23469 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPREP23469 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPREP23469 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPREP23469 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPREP23469 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPREP23469 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPREP23469 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPREP23469 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPREP23469 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPREP23469 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPREP23469 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPREP23469 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPREP23469 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms