Protein–RNA interactions for Protein: P22528

SPRR1B, Cornifin-B, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1BP22528 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms