Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAV1P15498 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAV1P15498 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAV1P15498 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VAV1P15498 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAV1P15498 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAV1P15498 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAV1P15498 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAV1P15498 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAV1P15498 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAV1P15498 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAV1P15498 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAV1P15498 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VAV1P15498 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAV1P15498 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VAV1P15498 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VAV1P15498 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAV1P15498 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAV1P15498 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAV1P15498 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAV1P15498 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAV1P15498 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAV1P15498 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAV1P15498 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAV1P15498 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAV1P15498 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAV1P15498 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAV1P15498 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAV1P15498 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAV1P15498 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAV1P15498 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VAV1P15498 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VAV1P15498 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAV1P15498 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAV1P15498 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAV1P15498 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAV1P15498 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAV1P15498 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAV1P15498 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAV1P15498 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAV1P15498 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAV1P15498 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAV1P15498 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAV1P15498 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAV1P15498 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAV1P15498 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAV1P15498 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAV1P15498 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
VAV1P15498 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAV1P15498 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAV1P15498 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAV1P15498 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAV1P15498 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAV1P15498 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAV1P15498 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAV1P15498 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAV1P15498 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAV1P15498 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAV1P15498 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAV1P15498 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
VAV1P15498 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAV1P15498 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAV1P15498 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAV1P15498 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAV1P15498 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAV1P15498 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAV1P15498 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAV1P15498 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAV1P15498 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAV1P15498 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAV1P15498 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAV1P15498 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAV1P15498 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAV1P15498 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAV1P15498 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAV1P15498 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAV1P15498 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAV1P15498 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAV1P15498 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAV1P15498 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAV1P15498 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAV1P15498 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAV1P15498 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAV1P15498 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAV1P15498 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAV1P15498 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAV1P15498 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
VAV1P15498 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAV1P15498 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAV1P15498 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAV1P15498 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAV1P15498 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAV1P15498 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAV1P15498 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAV1P15498 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAV1P15498 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAV1P15498 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
VAV1P15498 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
VAV1P15498 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAV1P15498 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms