Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms