Protein–RNA interactions for Protein: O95045

UPP2, Uridine phosphorylase 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP2O95045 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UPP2O95045 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UPP2O95045 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UPP2O95045 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UPP2O95045 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UPP2O95045 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UPP2O95045 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UPP2O95045 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UPP2O95045 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
UPP2O95045 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UPP2O95045 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UPP2O95045 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UPP2O95045 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UPP2O95045 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UPP2O95045 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UPP2O95045 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UPP2O95045 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
UPP2O95045 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UPP2O95045 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UPP2O95045 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UPP2O95045 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UPP2O95045 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UPP2O95045 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UPP2O95045 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UPP2O95045 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UPP2O95045 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UPP2O95045 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UPP2O95045 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UPP2O95045 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
UPP2O95045 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UPP2O95045 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
UPP2O95045 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UPP2O95045 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UPP2O95045 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UPP2O95045 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UPP2O95045 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UPP2O95045 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UPP2O95045 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UPP2O95045 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UPP2O95045 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
UPP2O95045 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UPP2O95045 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UPP2O95045 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UPP2O95045 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
UPP2O95045 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
UPP2O95045 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
UPP2O95045 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
UPP2O95045 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
UPP2O95045 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
UPP2O95045 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
UPP2O95045 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
UPP2O95045 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
UPP2O95045 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
UPP2O95045 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
UPP2O95045 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
UPP2O95045 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UPP2O95045 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UPP2O95045 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UPP2O95045 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
UPP2O95045 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UPP2O95045 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UPP2O95045 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
UPP2O95045 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UPP2O95045 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UPP2O95045 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UPP2O95045 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UPP2O95045 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UPP2O95045 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UPP2O95045 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UPP2O95045 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UPP2O95045 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UPP2O95045 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UPP2O95045 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UPP2O95045 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UPP2O95045 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UPP2O95045 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UPP2O95045 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UPP2O95045 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UPP2O95045 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UPP2O95045 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
UPP2O95045 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UPP2O95045 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
UPP2O95045 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UPP2O95045 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UPP2O95045 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UPP2O95045 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UPP2O95045 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UPP2O95045 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UPP2O95045 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UPP2O95045 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UPP2O95045 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
UPP2O95045 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UPP2O95045 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UPP2O95045 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UPP2O95045 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UPP2O95045 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UPP2O95045 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UPP2O95045 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UPP2O95045 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UPP2O95045 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms