Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.6 ms