Protein–RNA interactions for Protein: O00232

PSMD12, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD12O00232 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD12O00232 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms