Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C2

TCAF1, TRPM8 channel-associated factor 1, humanhuman

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Length 921 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCAF1Q9Y4C2 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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