Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms