Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM2AQ9Y2K7 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms