Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms